В новой части знаменитой игры мы переносимся в 1715 год. Пираты полностью завладели Карибскими островами и даже установили свою незаконную республику, где жадность, коррупция и жестокость стали делом привычным.

Среди этих пиратов выделяется смелый и молодой капитан, которого зовут Эдвард Кенуэй. Непростая борьба за славу дала ему большой авторитет, который можно сравнить с авторитетом легендарного пирата по прозвищу Черная Борода. Но эта борьба вовлекла его в войну между тамплиерами и ассасинами, которая способна уничтожить все, что образовали пираты.